🔔#你的肝包太多油了嗎❗❗
🎯#脂肪肝 是國人常見的肝臟疾病,早期沒有明顯症狀,長期下來卻可能演變為肝炎、肝硬化或肝癌,迄今仍缺乏有效治療藥物💊。本院生物化學研究所 #陳瑞華 特聘研究員團隊發現一種操控細胞自噬(autophagy)的新機制,✅經動物實驗證明能 #抑制脂肪肝形成。
#什麼是細胞自噬
細胞自噬是細胞的主要資源回收機制,可消除細胞內的老舊廢物,或選擇性地清除細胞內的過多脂肪。
👨🔬👩🔬研究團隊發現一個名為UBE3C的泛素接合酶與一個名為TRABID的去泛素酶,共同調控細胞自噬因子VPS34,以達到細胞內的恆定狀態 👇
1⃣UBE3C藉分枝型泛素化修飾VPS34蛋白質,導致VPS34降解(degradation),被分解為小片段,#抑制 細胞自噬功能。
2⃣TRABID去除VPS34的泛素化修飾,使其不被降解,#促進 細胞自噬。
團隊以高脂飼料餵食小鼠誘發產生脂肪肝後,發現小鼠肝細胞內 #TRABID表現量下降,#無法啟動肝臟細胞的自噬作用。當這些小鼠被注射以腺病毒載體攜帶的TRABID基因,四週後從細胞切片觀察,✅肝臟油脂含量明顯減少,✅能抑制脂肪肝形成。
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陳瑞華表示,「🎉本研究對於脂肪肝的治療提供新契機,若能研發出提高TRABID表現或其活性的 #藥物,則可能阻斷脂肪肝的形成,進而預防肝功能異常、肝臟發炎等相關疾病。」
🌏研究成果於本(110)年2月發表在國際期刊《自然通訊》(Nature Communications)。
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Fatty liver is a prevalent liver disease in Taiwan and worldwide and is associated with obesity, diabetes and cardiovascular diseases. Although fatty liver is normally asymptomatic, its progression can lead to hepatitis, cirrhosis, and even liver cancer. The research team of Dr. Ruey-Hwa Chen at Institute of Biological Chemistry identifies a novel autophagy regulatory mechanism and a potential of preventing fatty liver progression by manipulating this mechanism. The study has recently been published on February 26 in Nature Communications.
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📌論文全文:https://www.nature.com/articles/s41467-021-21715-1
📌新聞稿:https://www.sinica.edu.tw/ch/news/6826
📌Press Release: https://www.sinica.edu.tw/en/news/6826
#生物化學研究所 #中研院研究 #細胞自噬 #Fattyliver
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用深度神經網路求解「薛丁格方程式」,AI 開啟量子化學新未來
作者 雷鋒網 | 發布日期 2021 年 01 月 02 日 0:00 |
19 世紀末,量子力學的提出為解釋微觀物質世界打開了一扇大門,徹底改變了人類對物質結構及相互作用的理解。已有實驗證明,量子力學解釋了許多被預言、無法直接想像的現象。
由此,人們也形成了一種既定印象,所有難以理解的問題都可以透過求解量子力學方程式來解決。
但事實上能夠精確求解方程式的體系少之又少。
薛丁格方程式是量子力學的基本方程式,即便已經提出七十多年,它的氫原子求解還是很困難,超過兩個電子的氫原子便很難保證精確度。
不過,多年來科學家們一直在努力克服這一難題。
最近,來自柏林自由大學(Freie Universität Berlin) 的科學團隊取得了突破性進展,他們發表的一篇名為《利用深度神經網路解電子薛丁格方程式》的論文,登上《Nature Chemistry》子刊。
論文明確指出:利用人工智慧求解薛丁格方程式基態解,達到了前所未有的準確度和運算效率。該人工智慧即為深度神經網路(Deep-neural-network),他們將其命名為 PauliNet。
在介紹它之前,我們先來簡單了解薛丁格方程式。
什麼是薛丁格方程式?
薛丁格方程式(Schrödinger Equation),是量子力學中的一個基本方程式。又稱薛丁格波動方程式(Schrödinger Wave Equation),它的命名來自一位名為埃爾溫·薛丁格(Erwin Schrödinger)的奧地利物理學家。
Erwin 曾在 1933 年獲得諾貝爾物理學獎,是量子力學奠基人之一。他在 1926 年發表的量子波形開創性論文中,首次提出了薛丁格方程式。它是一個非相對論的波動方程式,反映了描述微觀粒子的狀態隨時間變化的規律。
具體來說,將物質波的概念和波動方程式相結合建立二階偏微分方程式,以描述微觀粒子的運動,每個微觀系統都有一個相應的薛丁格方程式,透過「解方程式」可得到波函數的具體形式以及對應的能量,從而了解微觀系統的性質。
薛丁格方程式在量子力學的地位,類似牛頓運動定律在經典力學的地位,在物理、化學、材料科學等多領域都有廣泛應用價值。
比如,應用量子力學的基本原理和方法研究化學問題已形成「量子化學」基礎學科,研究範圍包括分子的結構、分子結構與性能之間的關係;分子與分子之間的相互碰撞、相互作用等。
也就是說,在量子化學,透過求解薛丁格方程式可以用來預測出分子的化學和物理性質。
波函數(Wave Function)是求解薛丁格方程式的關鍵,在每個空間位置和時間都定義一個物理系統,並描述系統隨時間的變化,如波粒二象性。同時還能說明這些波如何受外力或影響發生改變。
以下透過氫原子求解可得到正確的波函數。
不過,波函數是高維實體,使捕獲特定編碼電子相互影響的頻譜變得異常困難。
目前在量子化學領域,很多方法都證實無法解決這難題。如利用數學方法獲得特定分子的能量,會限制預測的精確度;使用大量簡單的數學構造塊表示波函數,無法使用少數原子進行計算等。
在此背景下,柏林自由大學科學團隊提出了一種有效的應對方案。團隊成員簡‧赫爾曼(Jan Hermann)稱,到目前為止,離群值(Outlier)是最經濟有效的密度泛函理論(Density functional theory ,一種研究多電子體系電子結構的方法)。相比之下,他們的方法可能更成功,因在可接受計算成本下提供前所未有的精確度。
PauliNet:物理屬性引入 AI 神經網路
Hermann 所說的方法稱為量子蒙地卡羅法。
論文顯示,量子蒙地卡羅(Quantum Monte Carlo)法提供可能的解決方案:對大分子來說,可縮放和並行化,且波函數的精確性只受 Ansatz 靈活性的限制。
具體來說,團隊設計一個深層神經網路表示電子波函數,這是一種全新方法。PauliNet 有當成基準內建的多參考 Hartree-Fock 解決方案,結合有效波函數的物理特性,並使用變分量子蒙地卡洛訓練。
弗蘭克‧諾(Frank Noé)教授解釋:「不同於簡單標準的數學公式求解波函數,我們設計的人工神經網路能夠學習電子如何圍繞原子核定位的複雜模式。」
電子波函數的獨特特徵是反對稱性。當兩個電子交換時,波函數必須改變符號。我們必須將這種特性構建到神經網路體系結構才能工作。
這類似包立不相容原理(Pauli’s Exclusion Principle),因此研究人員將該神經網路體系命名為「PauliNet」。
除了包立不相容原理,電子波函數還具有其他基本物理特性。PauliNet 成功之處不僅在於利用 AI 訓練數據,還在將這些物理屬性全部整合到深度神經網路。
對此,FrankNoé 還特意強調說:
「將基本物理學納入 AI 至關重要,因為它能夠做出有意義的預測,這是科學家可以為 AI 做出有實質性貢獻的地方,也是我們關注的重點。」
實驗結果:高精確度、高效率
PauliNet 對電子薛丁格方程式深入學習的核心方法是波函數 Ansatz,它結合了電子波函數斯萊特行列式(Slater Determinants),多行列式展開(Multi-Determinant Expansion),Jastro 因子(Jastrow Factor),回流變換(backflow transformation,),尖點條件(Cusp Conditions)以及能夠編碼異質分子系統中電子運動複雜特徵的深層神經網路。如下圖:
論文中,研究人員將 PauliNet 與 SD-VMC(singledeterminant variational,標準單行列式變分蒙地卡羅)、SD-DMC(singledeterminant diffusion,標準單行列式擴散蒙地卡羅)和 DeepWF 進行比較。
實驗結果顯示,在氫分子(H_2)、氫化鋰(LiH)、鈹(Be)以及硼(B)和線性氫鏈 H_10 五種基態能量的對比下,PauliNe 相較於 SD-VMC、SD-DMC 以及 DeepWF 均表現出更高的精準度。
同時論文中還表示,與專業的量子化學方法相比──處理環丁二烯過渡態能量,其準確性達到一致性的同時,也能夠保持較高的計算效率。
開啟「量子化學」新未來
需要說明的是,該項研究屬於一項基礎性研究。
也就是說,它在真正應用到工業場景之前,還有很多挑戰需要克服。不過研究人員也表示,它為長久以來困擾分子和材料科學的難題提供了一種新的可能性和解決思路。
此外,求解薛丁格方程式在量子化學領域的應用非常廣泛。從電腦視覺到材料科學,它將會帶來人類無法想像的科學進步。雖然這項革命性創新方法離落地應用還有很長的一段路要走,但它出現並活躍在科學世界已足以令人興奮。
如 Frank Noé 教授所說:「相信它可以極大地影響量子化學的未來。」
附圖:▲ Ψ 表示波函數。
資料來源:https://technews.tw/2021/01/02/schrodinger-equation-ai/?fbclid=IwAR340MNmOkOxUQERLf4u3SK0Um6VQVBpvEkV_DxyxIIcUv8IP88btuXNJ6U
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對一直無法定下來的人來說,穩定交往中是好是壞?
人心難測,但對自然界中頑皮的 #雙原子碳 (Free C2) 來說,有穩交對象可能好一些。
#像極了愛情❤️
本院化學所王朝諺研究員帶領研究團隊,成功在常溫下幫雙原子碳找到「單一」☝️的穩定交往對象,對,不是二個或以上喔。
他們透過專業化學技術成功合成穩定的 #單配位基雙原子碳分子「R3P→C2」,成為全球首例!🌏
雙原子碳 (Free C2) 比較不穩定,一般僅能在燭光中藍色火焰或宇宙星際中才能觀察到。相較於穩定存在的氧氣(O2)和氮氣(N2),科學家較無法掌握其化學和物理性質,並進行後續應用。
此次研究團隊僅以 #單配位基 成功合成新分子,有助未來發展碳、矽、鍺等碳族之新型態化學反應,並應用於催化反應。
配位基如同中心原子的衣服,可以使不穩定的分子現形。配位基越少,分子的物理和化學性質越簡單乾淨,後續應用也能排除干擾因素。因此,為了要穩定中心原子,通常需要量身打造衣服。
⭐️王朝諺研究員解釋,「過去研究幫雙原子碳穿的衣服比較多件,我們這次一件搞定」。
本論文第一作者為中研院化學所✨梁子輝✨博士後研究人員,研究團隊包括中研院化學所✨吳銘峻✨博士生、通訊作者王朝諺研究員。
🎯簡單知道就好:https://www.sinica.edu.tw/ch/news/6758
🎯專業的進來讀:https://www.nature.com/articles/s41557-020-00579-w
#化學所 #王朝諺 #梁子輝 #雙原子碳 # dicarbon # singlephosphineligand
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Our recent scientific breakthrough led by Prof. Dr. Tiow-Gan Ong (Research Fellow), Dr. Tsz-Fai Leung (Postdoctoral Research Fellow) and Mr. Ming-Chun Wu (Ph.D. graduate student) at Institute of Chemistry, Academia Sinica successfully presents the first straightforward way to isolated stable C2 molecule at ambient temperature as a R3P→C2 using our special custom-made bulky phosphine ligand bearing super electron-rich imidazolidin-2-iminato groups. This work is manifestation of the most state-of-the-art chemical synthesis ingenuity approach to stabilize C2. This important scientific discovery also provides chemical and electronic insights into long-standing difference of scientific interpretations over nature of C2.
🎯newsrelease: https://www.sinica.edu.tw/en/news/6758
🎯The full article: https://www.nature.com/articles/s41557-020-00579-w
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How to Attract The Signs?
What is the chemistry to attract people or the one you have a crush on? How to attract the signs? This video would help you to attract the one you like quickly through the theory of zodiac signs! Let's find out how though this video about different signs!
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Zodiac signs are controlled by 4 main elements, earth, water, air and fire. There are magical chemistries between each signs and elements, through my videos, they will make you feel empowered, confident, and in control of your romantic destiny again. Use your intuition to guide you. If this message doesn’t resonate with you, feel peaceful and find the one that does. Ultimately, you must always use your own judgement, wisdom and discrimination when making life decisions.
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すみちゃん4歳がお父さんとお母さんと一緒に公園に行って虫取りをしました^^ショウリョウバッタがたくさん取れました。最後は、お父さんとお母さんは帰ろうとしているのに、まだまだ遊びたいと帰ろうとしないすみちゃんの様子です(汗)
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