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【暫時停止於Twitch直播】
在這邊跟大家公告，從今天起的FGO生放和2-6後篇口譯期間，
我們都只會單獨在Youtube上開台，Twitch的處理將暫時放置到主線完結後。
大家應該都多少知道最近開台的線路狀況時好時壞，昨天在玩NGS又直播斷線。
但終於歸咎出問題出在我一直在用的多平台直播系統restream上。
但今天FGO就要上工了，我也沒時間再找其他平台做嘗試，所以只好先回歸單平台直播了。
這其實也算不上多震撼，以前我們就一直遇到直播的種種問題。
之前就說要找時間回歸單平台直播看看，但最後都沒有實際去測試而已。
至少是在上工前就發現問題所在，而不是FGO開始口譯了才出狀況也算萬幸了。
然後可能我錯怪網路公司了呵呵XD
對於習慣使用Twitch的觀眾們只能先說聲抱歉了，
FGO都口譯完以後我才會再回去用看看restream或者找其他平台吧。
希望到時候能再回來使用雙平台給大家方便！
那麼今天起要再被收押回去妖精鄉了，再請大家多多指教！
#teaching #genetics
病史是問診的主要內容，包括主訴、現在史、過去史、家族史等。其中以家族史最容易被年輕的醫生忽略。
CKD 的遺傳度是 30-75%：單核苷酸多態性（SNP）或全基因組關聯分析的研究發現有關的基因是尿調理素 UMOD（又被稱為 Tamm-Horsfall 蛋白質 ）、SHROOM3、溶質轉運器、E3 ubiquitin ligases 等。要注意的是以上這些都只是相關性，而不是因果相關，亦即 CKD 可能是多基因遺傳。更複雜的是即使是遺傳疾病，病人的表現型也會受到環境的交互影響：表現型的變異數 = 基因型變異數 + 環境變異數 + 基因 x 環境變異數。遺傳度 = 基因型變異數/表現型的變異數。
最常見的單基因遺傳性腎臟病是多曩腎（ADPKD），盛行率是百萬分之 270。其次是 Alport 症候群，這是腎絲球基底膜 GBM 第四型膠原蛋白 Col4 基因突變（缺乏 Col4 的 α3、α4、α5 鍊）引起的性聯遺傳腎臟病（少數是體染色體隱性遺傳），盛行率是百萬分之 100。
其次是法布瑞氏症（性聯顯性遺傳，盛行率是百萬分之 20），其病因是缺乏 A 型 α 半乳糖苷酶（GLA）基因導致 glycosphingolipid（globotriaosylceramide） 堆積，α-galactosidase 酵素補充治療有效。
最近有人針對遺傳性局部節段性腎絲球硬化（FSGS）的家族做全基因次世代定序 NGS，結果發現有高達 10% 的病人有 α3 或 α4 鍊的基因突變，亦即由臨床和病理表現都無法區分亞伯氏症候群和 FSGS。也有人用 NGS 發現曩腫性腎病患者有 78% 有基因異常，家族性腎絲球腎炎患者有 62% 有基因異常。
其他的單基因遺傳性腎臟病有體染色體顯性腎小管間質性疾病（ADTKD，以前稱為家族性青少年型高尿酸血性腎臟病、幼年性腎消耗病-腎髓質囊腫疾病 MCKD）是一種纖毛病，分為 UMOD、MUC1、REN 數種，其症狀是 CKD、沒有血尿/蛋白尿、尿液沈渣陰性、尿液濃縮能力下降等。
一個對歷史學科了解不多的人
https://medium.com/…/%E5%B0%8D%E6%AD%B7%E5%8F%B2%E5%AD%B8%E…
「你的父母是誰？」
https://medium.com/…/%E4%BD%A0%E7%9A%84%E7%88%B6%E6%AF%8D%E…
➥【重點摘要】：
本文作者們透過基因體分析試圖解釋SARS-CoV-2的起源。同時，無論蝙蝠或是可能存在的中間宿主，在這些野生動物中的病毒除了多樣性外，也不斷持續演化。作者強調，減少未來爆發疾病的風險最簡單、最具成本效益的方法是限制我們與動物病原體接觸的可能。雖然現實世界裡我們和動物的緊密關係意味著我們不太容易建立牢固的屏障，但更強烈反對非法野生動植物交易並禁止市場中販售野生哺乳動物將提供人和野生動物之間重要的緩衝區。
■ 全新的人類冠狀病毒
由於有許多輕症，甚至無症狀感染者難以被估計，因此感染SARS-CoV-2實際的死亡率應該會比現在的數據更低。死亡率也隨地區、年齡、時間而不同。雖然還需要更大規模的研究分析，但是現今多認為COVID-19的死亡率低於另外二種近期同樣感染人 類的冠狀病毒：SARS-CoV及MERS-CoV。然而，越來越的證據也顯示，SARS-CoV-2的傳染力比SARS-CoV或是MERS-CoV更強，並且在感染者無症狀或是症狀出現之前就具有傳染力。
這一波大流行的第一例推測是與武漢的華南海鮮市場有關。作者曾在2014年10月造訪該市場，發現當地販賣許多活的哺乳類野生動物。過去認為冠狀病毒起源於動物，因此此波疫情肇因於該市場似乎也不意外。但是，作者也認為，最初的病例也並非每一個都與該市場有直接關聯。即使從市場環境取得的樣本經由基因體分析證實與從早期病人檢體中所得到的病毒序列很接近，仍然不能排除環境樣本是否為人或動物無意中在該市場留下的傳染性材料。所以整個傳染病故事是如何發生的，其原因可能比已知的更為複雜。如果無法直接從市場中某種動物體內找到病毒，將很難斷定到底此一新型冠狀病毒的動物起源為何。
作者接著說明最早的病毒基因體研究是從一位在2019年12月26日，大約發病後第6天於武漢中央醫院住院的病例開始調查。1月5日得到NGS的資料證實病毒屬於冠狀病毒科，隨即也在病毒相關網站上公開此訊息。直到投稿時，已經有200個SARS-CoV-2病毒序列在網路上被公開免費查閱了。這些資訊對後來研發診斷、疫苗、抗病毒藥物，以及臨床試驗有莫大的幫助。
■ SARS-CoV-2與其他冠狀病毒的差異
SARS-CoV-是Betacoronavirus屬、Sarbecovirus亞屬的一員，同亞屬中另有SARS-CoV病毒。之前已知SARS-CoV-2與SARS-CoV在核苷酸的層次上有將近79%的相似度，但是不同基因之間的相似程度有差異，例如，兩者間的棘蛋白(Spike, S)相似度只有72%。另外，兩者皆是利用宿主細胞上的ACE2 受體與宿主細胞結合。SARS-CoV-2還有一個furin切割點，插在S蛋白S1、S2次單元的交接處，可能會造成病毒的感染力增強。其他Betacoronavirus屬的病毒則沒有此插入點。在一些生物特徵上，SARS-CoV-2也有不同於SRAS-CoV及MERS-CoV的獨特性：SARS-CoV-2的傳染力更強，所以在傳播、流行的動態與其他二者完全不同。
■ 動物起源
早期的基因組比較顯示與SARSCoV-2關係最密切的病毒來自蝙蝠。近年來在蝙蝠的採樣也發現了許多冠狀病毒，包括RaTG13和RmYN02。 因此，對於多種冠狀病毒而言，蝙蝠無疑是重要的儲藏物種。儘管如此，蝙蝠在SARS-CoV-2的人畜共患起源中的確切定位仍未十分確定。特別是與SARS-CoV-2關係最密切的蝙蝠病毒樣本是取自距武漢1500多公里的雲南省的動物，湖北省的蝙蝠冠狀病毒與SARS-CoV-2在基因序列上的差異反而是比較大的。另外，儘管96-97%的序列相似性聽起來好像蝙蝠病毒與SARSCoV-2密切相關，實際上這樣的差異可能代表經歷了20多年的演化（當然如果病毒在人體內有很強的適應性，則演化的速度也會加快）。 因此，幾乎可以肯定的是還需要更多的採樣找出與SARS-CoV-2親緣關係更近動物來源。
此外，其他哺乳動物物種很可能再蝙蝠與人類之間充當“中間”或“擴增”宿主，SARS-CoV-2能夠在其中發生部分或全部突變而成為有效的人類傳播病毒。就SARS和MERS而言，麝香和駱駝分別扮演了中間宿主的角色。因此，最近發現非法進口到中國南部（廣東和廣西兩省）的馬來亞穿山甲（Manis javanica）中帶有與SARS-CoV-2非常相近的病毒就值得注意。
另一個受到廣泛關注的問題是SARS-CoV-2是否是重組病毒，以及此重組是否有助於病毒的出現。作者認為很難區分。原因是Sarbecovirus或是更廣義的冠狀病毒原本就會進行基因重組，而且，許多重組的區域可能很小，所以要區分此有利於病毒出現的重組與一般背景的重組，實非易事。為了解決這些問題，有必要對動物種群進行更廣泛的採樣以了解病毒的多樣性。
■ 進行中的基因體演化
鑑於RNA病毒的突變率很高，因此更多的突變將出現在病毒基因組中，這些突變將幫助我們追踪SARS-CoV-2的傳播。但是，隨著流行幅度快速增加，相對於病例總數，我們能檢測的樣本數可能會非常小，以至於很難檢測到各個傳播鍊。 因此，在嘗試推斷確切的傳播事件時必須始終保持謹慎。
(「財團法人國家衛生研究院」齊嘉鈺醫師 摘要整理)
📋 A Genomic Perspective on the Origin and Emergence of SARS-CoV-2(2020/03/26)+中文摘要轉譯
➥Author： Yong-Zhen Zhang, Edward C. Holmes
➥Link： cell
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30328-7
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